甲狀腺囊腫是甲狀腺的囊性腫物，屬于甲狀腺的病理形態學改變，而并非是一個是一個單一的疾病。引起甲狀腺囊腫的最常見疾病是單純性結節性甲狀腺腫;其次為甲狀腺腺瘤;少數為甲狀舌管殘余及第四腮裂殘余;極少數為甲狀腺癌。
甲狀腺囊腫根據其內容物質可分為膠性囊腫、漿液性囊腫、壞死性囊腫、出血性囊腫和混合性囊腫。因此，甲狀腺囊腫不同于甲狀腺膿腫。后者繼發于急性化膿性甲狀腺炎，其內容物為膿液，臨床鑒別較容易。
甲狀腺囊腫患者一般無自覺癥狀，囊腫較大或位于甲狀腺下極可出現頸部壓迫癥狀。良性甲狀腺疾病所致囊腫多表現為頸部結節性腫物，結節可柔軟有囊性感，也可呈堅實結節感，表面光滑，隨吞咽活動好;甲狀腺癌性囊腫多為形態不規整結節，質地較硬，表面不光滑，活動受限。
甲狀腺囊腫實驗室檢查對于確診囊腫和判斷性質有一定意義。不管囊腫病變性質如何，同位素掃描多顯示為冷結節，如囊腫處覆蓋有較厚的甲狀腺組織或膠質性結節囊變時，可呈現為溫結節。甲狀腺穿刺囊液呈血性，反復抽吸后又迅速積聚，也提示癌性囊腫的可能，應送穿刺液找癌細胞，以明確診斷。