最常見的治療兒童癲癇的方法，就是從單藥治療開始，長期規律服藥，減藥過程要慢，按發作類型及病癥類型選藥，療效判斷要以臨床及藥物濃度測定為標準，定期復查，留意藥物的毒副作用，視具體情況調整藥量。單一用藥可使大多數病兒在毒性較小的情況下完全控制發作，幾種藥聯合應用時，常因藥物的相互作用而影響療效，還可增加藥物的毒副作用。對難治性兒童癲癇的治療，有時需要同時用兩種以上的藥物，但需在有經驗的小兒神經科醫師指導下用藥。
兒童的組織器官柔嫩，功能不完善，對抗癲癇藥的吸收、分布、代謝、排泄等都不同于成年人，用藥過程要根據這些特點來斟酌分析靈活應用，強調個體化，控制副作用，采用療法，標本兼治。在兒童癲癇的治療過程中同時要留意保護好大腦功能，只有在腦功能良好的基礎上，抗癲癇藥才能發揮有效作用。治療兒童癲癇時需要指導家長、學校及患兒對疾病有正確認識，說明長期規律治療的重要性，應堅持到醫療單位定期隨訪。安排正常的學習及生活規律，避免各種可能誘發疾病發作。
治療癲癇還是需要新技術，兒童癲癇最新癲癇病治療方法是什么?專家說，“超導納米芯片神經康復療法”利用優秀檢查定位技術，迅速準確的找出癲癇病灶部位。然后通過使用生物納米技術將納米芯片植入癲癇病灶，芯片植入后，其產生的電磁場能迅速作用于癲癇病灶，激發神經自身保護功能，促使神經功能恢復，進而在腦部形成穩定的生物磁場，調整腦部神經網電路失衡，使異常放電的神經元電位趨于平衡，從而產生鎮靜、解痙作用。