經過長時間的臨床研究表明：此病與多種因素相關，目前白塞氏病病因尚不十分明確。有人認為是病毒感染或對感染因素的過敏反應引起，但還未得到充分的證明。
最近在免疫學方面段主任發現有些病人血清中免疫球蛋白、免疫復合物等均升高，并有多種抗體，如抗口腔粘膜抗體、抗動脈壁抗體等。所以有人認為本病可能是某些因素，其中包括病毒所誘發的一種自身免疫病。
一、濕毒內蘊
由于感受濕熱毒氣，或恣食膏粱、炙膊、不潔之物，致使濕濁內蘊，日久化熱，或熱病、毒痢、斑疹等溫熱病后，余毒未盡，與濕濁相合，濕熱邪毒壅蒸不得透泄，循經絡上蝕口眼，下注外陰而致潰瘍。毒火熏蒸，擾亂心神，又見神情恍惚，坐臥不安。
二、肝腎陰虛
若汗、吐、下太過，或下痢日久，傷津耗液;或為情志所傷，肝郁化火傷陰;或熱病后養息不當，陰液難復;或房勞過度，腎有所虧，以致肝腎陰虧，陰精不足則津液虧損，難以上潤下濡。虛火內灼，上沖肝竅，下出腎竅，而致本病。
三、脾腎陽虛
脾土本虛，或長期服用苦寒藥，以致中陽受損，健運失司，水濕內聚，稟賦素虛，或勞役傷腎，致腎陽虛損，氣化失利，水流橫溢，水濕為聚，積久蘊為濕毒，陰濕內盛，流注經絡、體竅，發為癰瘍，本病作矣。
總之，白塞氏病發生絕非偶然。本病的病情演變頗為復雜，病之初期和急性活動期多呈現熱毒壅盛的實證，中、晚期則多為本虛標實或虛實夾雜之候，由于久病體虛，窮及脾腎，陽損及陰，陰損及陽，最終陰陽俱衰，而成難治之病。
提示：對因治療白塞氏病效果好。
白塞氏病的病因不同，患者不同的癥狀表現進行臨床研究發現預后效果是不同的，多數患者病情長期處于緩解-復發交替的狀態，部分患者經有效治療后能達痊愈。僅表現為口腔潰瘍或皮疹的患者預后較好，表現為系統受累者，如眼部、神經系統和腸道受累，不治療則預后不好，嚴重者導致失明、腸穿孔或死亡，所以需積極治療，并且治療越早、效果越好。