臨床工作中可以看到，多發性抽動癥患兒有時發病幾年后才得以確診。有報道首診誤診率高達70%。由于病程的延長，使治療更加困難?？偨Y臨床資料，主要有以下幾種情況造成延誤診斷：
(1)醫生認識不足。多發性抽動癥患兒**癥狀多是干咳、眨眼等等。故多被診斷為常見的咽炎、支氣管炎、眼結膜炎及慢性鼻炎。反復就診于內科、五官科等。 還有的醫生認為多發性抽動癥必須有穢語方可診斷。實際上只有1/3左右的患兒在發病幾年以后才出現穢語情況。大部分患兒在整個病程中也不出現穢語現象。
(2)家長認識不足。由于發病率相對較低，家長對此認識不夠。見到孩子不停眨眼、清嗓子時，家長會認為是小毛病，不會帶孩子去看醫生。有的家長在被醫生告訴是多發性抽動癥后，亦不能引起重視，認為對孩子生長發育不會有太大影響，因而不按時就診。
(3)患兒的自我保護。由于患兒平時的不自主抽動如眨眼、清嗓子聲音等等，時常遭到家長及周圍伙伴們的訓斥和譏笑，故在人前竭力遏制抽動癥狀。在疾病的早期是可以暫時控制的。使家長及醫生不易察覺，從而未能及時就診和治療。
(4)由于一些多發性抽動癥和其他神經精神障礙共存，使多發性抽動癥的癥狀更為復雜，如除了抽動癥狀外還共存強迫障礙、多動癥或其他行為障礙，給診斷帶來困難，也是誤診的主要原因。