高血脂癥的病因，基本可以分為兩大類，即原發性高血脂癥和繼發性高血脂癥。
原發性高血脂癥
1.遺傳因素。遺傳可通過多種機制引起高血脂癥，某些可能發生在細胞水平上，主要表現為細胞表面脂蛋白受體缺陷以及細胞內某些酶的缺陷(如脂蛋白酶的缺陷或缺乏)，也可發生在脂蛋白或載脂蛋白的分子上，多由于基因缺陷引起的。
2.飲食因素。飲食因素作用比較復雜，高脂蛋白血癥患者住院中有相當大的比例是與飲食因素密切相關的。
繼發性高血脂癥
繼發性高血脂癥是由于其他中間原發疾病所引起者，這些疾病包括：糖尿病、肝病、甲狀腺疾病、腎病疾病、胰腺、肥胖癥、糖原累積病、痛風、異常球蛋白血癥等。
1.糖尿病與高脂蛋白血癥在人體內糖代謝與脂肪代謝之間有著密切的聯系，只是臨床研究發現，約40%的糖尿病患者可繼發引起高血脂癥。
2.肝病與高脂蛋白血癥現代醫學研究資料證實，許多物質包括脂質和脂蛋白等是在肝臟進行加工、生產和分解、排泄的。一旦肝臟有病變，則脂質和脂蛋白代謝也必將發生紊亂。
3.肥胖癥與高脂蛋白血癥臨床醫學研究資料表明，肥胖癥最常繼發引起血甘油三酯含量增高，部分患者首先血膽固醇含量也可能會增高，大多主要表現為iv型高脂蛋白血癥，其次為iib型高脂蛋白血癥。