多數化療藥物都有較大的毒副作用，施行化療時，應透徹了解藥物因素（包括藥品種類、劑量、治療途徑及日程，細胞逆轉和藥理動力學，藥物的膜透過性和到達情況，藥物的活化和非活化、主要毒副作用等）。宿主因素（包括一般情況、年齡、外周血及骨髓機能、免疫狀態等）和腫瘤因素（胃癌類型、生物學行為、擴散及浸潤程度、抗藥性等），處理好藥物、宿主、腫瘤三者之間的相互關系。化療過程中應不斷注意分析、掌握這三大因素關系的發展與變化，促成這些因素的協同方面，有利于消滅癌細胞、減輕對宿主的損害，以期在避免“化療死”（chemotherapy death）的前提下，更多地或全部地殺滅癌細胞。比如一般狀態和骨髓、免疫功能良好，先前未行化療，而以腺癌細胞為主者，則是化療的良好適應癥；又如65歲以上的高齡病人，全身狀態衰弱，白細胞在3×10⁹/L以下，血小板低于8×10¹⁰/L，已用過大量多種緩癌藥或放療者，再行化療時宜慎重或一般不易施行。從胃癌的生物學行為看，局限性、團塊狀生長、高分化腺癌易發生肝轉移，故除一般化療原則外，應著重考慮預防肝轉移的治療措施；浸潤型、彌漫性生長、分化不良的胃癌易發生腹腔內擴散，除全身化療外，應考慮腹腔內給藥。化療方案的選定要遵循NCCN治療指南，要遵循循證醫學，堅持個體化、規范化的治療原則。