上海海軍基地醫院最早成立于1951年2月，是最早的醫療單位之一。海軍上海基地醫院是承擔海軍上海部隊及周邊居民的醫療、預防、保健及康復任務的三級甲等綜合性醫療，為上海市醫保定點單位，虹口區質量管理先進單位。醫院集醫療、教學、科研為一體，專科齊全、設備先進、技術精良。現有整形美容中心、腫瘤治療中心、性傳播疾病中心、脊柱外科、口腔醫學、海洋藥學等多個專科中心，設有38個科室，展開床位800余張，擁有各類專業技術人員600余名。醫院堅持走質量建院、科技興院之路，立足實際，加大投資，開設各大專科特色門診，并得到了長足的發展。

　　在醫院黨委的領導下，醫院軟、硬件設施近年來得到極大改善，培養和引進博士、碩士70余名，"七五"至"九五"期間獲得軍隊科技進步獎 、臨床醫療成果獎百余項，承擔上海市科委課題4項。在"上海市跨世紀學科帶頭人培養百人工程"中，醫院有多人被列入培養對象。建造了現代化的外科病房大樓，改建了內科、門急診大樓，配置核磁共振、螺旋CT、1250毫安多功能X線機、數字減影機、彩色多普勒超聲診斷儀、全自動生化分析儀、微生物分析儀、血球計數儀、電子胃鏡、電子喉鏡等大型醫療設備200余臺件，能完全滿足各類病員的診療需要。 醫院高度重視醫療質量工作和醫德醫風工作，廣大醫務人員服務精，醫德好，醫院多次被總后評為優質服務先進單位，并被授予"白求恩杯"。