中醫學認為，肛瘺的形成與以下幾個方面有關：

　　(1)外感六淫之邪所致：如《河間六書》云：“蓋以風、熱、燥、火、濕邪所致，故令肛門腫滿，結如梅核，甚至乃變而為瘺也。”《本草綱目》云：“漏屬虛與濕熱。”均明確認識到肛瘺與風、熱、燥、火、濕邪侵襲人體有關。

　　(2)痔瘡久而不愈：《諸病源候論》云：“痔久不瘥，變為瘺也”.

　　(3)飲食肥甘厚味，恣酒，憂思，便秘，房勞過度：《千金方》云：“肛門主肺，肺熱應肛門，熱則閉塞，大行不通，腫縮生瘡”.《丹溪心法》曰：“人唯坐臥濕地，醉飽房勞，生冷停寒，酒面積熱，以致榮血失道，滲入大腸，此腸內臟毒之所由作也。”而《外科正宗》云：“夫臟毒者，醇酒厚味，勤勞辛苦，蘊毒流注肛門結成腫塊。”

　　(4)其他原因：《薛氏醫案》云：“臀，膀胱經部分也。居小腹之后，此陰中之陰，其道遠，其位僻，雖太陽多血，氣運難及，血亦罕到，中年后尤慮此患。”據此，認為肛瘺與局部氣血運行不足有關。

　　國內是世界上認識肛瘺最早的國家，其病名最早見于《山海經》。中醫認為肛瘺的病因病機大體有三種情況。

　　一是外感風、濕、熱、燥、火等六淫邪氣，順胃腸傳于下部，使肛門腫滿，"結如梅李核"，然后轉變為肛瘺。所謂"結如梅李核"，是講在肛門邊緣鼓出如梅核或李核大小的硬結。

　　二是久痔不愈毒氣聚結肛邊，瘡口不合.時流膿血而成感_三是飲食辛辣，醇酒厚味.或情念不暢，勞累過度，產生濕熱，下注肛門，潰腐成癰，肛癰潰后不斂，則成肛瘺。總之，中醫關于肛瘺成因的論述，核心思想是體內產生濕熱毒火，下注于肛門而成。濕熱的來源多源于飲食，所以中醫很強調飲食要有節制。