據統計，藥流的成功率只有75%左右，相對于無痛人流99%的成功率顯然是低了很多。而一旦出現流產不干凈，殘余的胎膜組織會造成血崩，須立即入院進行刮宮清理，否則會有生命危險。在上海411醫院門診經常會碰到一些藥流后造成大出血的患者。即使不會造成大出血，殘余的胎膜組織也會影響日后孕育。因此，選擇做藥流，將面臨以下風險:

一、藥物的副作用。據世界衛生組織統計，世界各國多次報道女性在服藥過程中突發死亡的病例。此外，藥流還會損傷卵巢，打亂女性內分泌，導致容顏加速衰老。

二、流產不全二次清宮。二次清宮機率很高，一旦出現流產不干凈，殘余的胎膜組織會造成血崩，須立即入院進行二次刮宮清理，否則會有生命危險。

三、流產后并發的感染。藥流后，陰道出血時間較長，少則十幾天，多則一個多月。在這過程中，整個生殖道極易感染，造成陰道炎、宮頸炎、盆腔炎、附件炎等各種疾病。

鑒于藥流的巨大風險，國家規定必須是在有授權許可的醫院和醫生的指導和監督下實施，嚴禁私自藥流。但是，在我國，意外懷孕的女性可以私自買到打胎藥在家吃，造成大出血以致死亡的病例比比皆是，而且造成感染留下后遺癥的比例極高。