1、尿道炎治療藥物選擇不當，淋球菌對之耐藥。
2、再感染，性伴未經治療。
3、患者未按醫囑用藥，飲酒以及辛辣食物可影響療效。
4、只給予抗一種病原體的藥物，忽視了混合感染。
5、滴蟲引起的尿道炎。
6、某些細菌感染導致非特異性尿道炎。
7、可以由于局部抵抗力下降而導致前列腺炎。
8、尿道粘膜炎癥性損害如水腫、增生尚未恢復，或者局部神經受牽拉，可以出現癥狀。