系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病原因，尚不完全清楚，一般認為是多因素的，可能與遺傳、性激素、環(huán)境等多種因素相互作用造成機體免疫功能紊亂關。 遺傳傾向

　　經大量研究表明，系統(tǒng)性紅斑狼瘡有遺傳傾向性及家族發(fā)病聚集性。當家庭中某一成員患系統(tǒng)性紅斑狼瘡，則其他成員的發(fā)病率增加，有5%-12%的一級親屬(父母、兄弟、姐妹)發(fā)病;同卵雙生同胞的系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病一致率為25%- 70%，明顯高于異卵雙生子的1%-3%;某些人種的發(fā)病率顯著高于其他人種，如黑種人的發(fā)病率高于一般人群的3倍;人類遺傳基因研究發(fā)現(xiàn)：某些人類白細胞抗原(HLA)與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病有關;先天性補體C4及C2的缺乏，也易發(fā)生系統(tǒng)性紅斑狼瘡。目前世界上許多風濕病學家正在尋找導致系統(tǒng)性紅斑狼瘡的致病基因。遺傳因素作為一個內因，還要有某些外因參與才可能發(fā)病。

　　雌激素的作用

　　系統(tǒng)性紅斑狼瘡好發(fā)于中青年女性，育齡期女性的發(fā)病率比同齡男性高9—13倍，但青春期前和絕經期后女性患病率低，僅略高于男性。正值育齡期的中青年女性，體內雌激素水平遠高于一般人群。通過大量的研究證實，雌激素對系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病起著重要的作用，它能遏制細胞免疫和增加自身抗體的形成。臨床實踐中也發(fā)現(xiàn)一些病人在月經初潮后或產后發(fā)病，口服含雌激素的避孕藥也可誘發(fā)本病，約1/3的系統(tǒng)性紅斑狼瘡病人，在妊娠期間病情惡化，或在分娩后疾病由原來的緩解期轉為活動期。

　　環(huán)境因素

　　環(huán)境因素在系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病中具有重要的意義。約 40%的病人暴露于陽光或紫外線中，可見面部蝶形紅斑加重，或出現(xiàn)新的皮損，或使全身癥狀加重，這種現(xiàn)象稱為光敏感。磺胺類、四環(huán)素等藥物因為能誘發(fā)光敏感，所以會增強紫外線的效應。含有補骨脂素的食物，如芹菜、無花果等具有增強系統(tǒng)性紅斑狼瘡病人光敏感的潛在作用。系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病與病毒感染有關。在系統(tǒng)性紅斑狼瘡病人的肝、脾及白細胞組織中提取出C型病毒抗原，并在腎小球、血管內皮和皮膚損害部位發(fā)現(xiàn)類似包涵體成分，但至今尚未從系統(tǒng)性紅斑狼瘡病人組織中分離出C型病毒。此外，有人認為，系統(tǒng)性紅斑狼瘡發(fā)病與結核感染、鏈球菌感染及其他病毒感染，如麻疹病毒、EB病毒和風疹病毒感染有關，但均無肯定性依據(jù)。

　　普遍的看法認為是環(huán)境因素作用于一定遺傳背景的機體，包括性激素的影響諸因素作用形成的結果。因此，遺傳素質很強，則弱的環(huán)境刺激也可引起發(fā)病，反之，遺傳素質雖不很強，但環(huán)境刺激足夠強也可致病。