醫院臨床信息化建設是一項艱巨的長期任務，臨床信息采集以及軟件實施需要大量資金投入。通過臨床信息系統應用，確實能夠提升醫院醫療質量，提高臨床工作效率，但臨床信息化建設的首要問題是如何評價系統投資成本以及收益效果。

    上海交通大學附屬第六人民醫院鄭西川等人在《國內醫院》雜志2012年第9期發表了《臨床電子醫囑CPOE對醫療質量的影響與投資效益研究 》文章。文章指出，臨床電子醫囑（CPOE）實施實際上是醫院臨床信息設施和IT技術管理重組的過程，涉及醫生、護士、臨床組織架構以及領導力重新調整。CPOE應用與CDS的結合，能夠極大地改進臨床醫療質量，提升患者滿意度。上海交通大學附屬第六人民醫院通過CPOE實施全面提升了患者醫療質量，通過臨床決策支持系統初步應用，CPOE的潛力得到挖掘發揮，為臨床醫療和成本控制提供了管理工具。在臨床醫療方面，沒有CPOE應用，許多藥品不良事件并未在病歷文檔中記錄，而通過CPOE可以避免造成患者精神和身體傷害的事件發生。研究發現，醫院藥物不良反應（ADEs）導致患者傷殘賠付以及重復檢查、重復化驗花費的成本很大，保守估計通過CPOE應用可以至少降低10.4%的ADEs事件，同時CPOE提高了臨床工作效率，約24～26個月可以收回CPOE實施和培訓投資成本。
    文章認為，醫院電子病歷應用應重視CPOE系統實施，有條件的醫院應全面實施醫生臨床醫囑，包括臨床決策支持信息系統。CPOE實施需要各方協同工作，醫學信息界應重視CPOE性能標準研究，以確保CPOE的有效使用，性能要求應包含對臨床不良事件降低的要求。政府管理部門應鼓勵醫院開發實施適合自己要求的CPOE系統，并在資金投入上對CPOE開發、實施及相關流程改進提供支持。應繼續關注改進患者醫療質量，降低醫療成本的信息技術，并適時對這些技術進行評估和支持。CPOE實施為醫院和患者創造了雙贏機會，通過減少藥品不良反應事件，改進醫療質量，減低醫療成本，更加符合醫療衛生政策，同時實施CPOE系統也能在醫療質量和財務收益方面帶來更多的好處。